Роғун аз самти шарқ бо қаторкӯҳи Қаротегин ё қаторкӯҳи Дарвоз ва аз самти ҷануб бо кӯҳҳои ноҳияи Файзобод иҳота шудааст.
Иқлими мусоид ва заминҳои ҳосилхез имконият медиҳанд, ки кишоварзӣ ва боғдорӣ рушд кунад. Дар деҳаҳои Роғун себ, тут, чормағз, зардолу, нок ва ангур парвариш карда мешаванд. Флораи шаҳр хеле бой аст. Дар минтақаҳои кӯҳӣ дарахтон ва буттаҳои гуногун – писта, бодом, себ, анҷир, олу, гелос, нок, арча, заранг, булут, чинор, сафедор ва ғайраҳо мерӯянд. Даштҳо дар баландии беш аз 3500 метр ҷойгиранд.
Дар буттазорҳои зич ва баландии кӯҳҳо ҳайвоноти ваҳшӣ зиндагӣ мекунанд, аз ҷумла бузҳои кӯҳӣ, хирсҳо, хуки ваҳшӣ, ҷайрон, сангпушти кӯҳӣ, харгӯш, қурбоққаҳо, гургҳо, рӯбоҳҳо, шағолҳо ва аз хазандагон намудҳои гуногуни мору калтакалосҳо дида мешаванд.