История
Гиссарская долина известна как территория, по которой пролегала караванная торговая дорога -Великий шелковый путь.
Жизнь в этом месте началась еще в каменном веке, в IV–III тысячелетиях до нашей эры. Позднее территория долины входила в состав Бактрии, потом Греко-Бактрийского и Кушанского государств. Об этом свидетельствуют найденные археологами остатки древних городищ и поселений. Сегодня, правда, от них остались лишь округлые насыпи, называемые «тепа» - «холм». Во времена владычества Арабского халифата местное население приняло ислам.
В 9 — 10 вв. она входила в состав Саманидского государства. Впервые эта территория под названием «Гиссар» («Хисор») упоминается в XI веке. Тогда это слово обозначало городище, где расположены государственные войска и развивалось ремесло.
В средние века Гиссар был городом, известным своим ремесленничеством и рыночным центром. В XVIII - XIX веках он превратился в Гиссарское бекство – одно из 28 владений Бухарского эмирата. С этих времен сохранилась Гиссарская крепость – самый известный памятник заповедника.
В начале XX века, после падения эмирата, Гиссар входил в состав Таджикской советской республики.
С 9 сентября 1991 года Гиссар - район, а позже – город в составе группы городов и районов республиканского подчинения Республики Таджикистан.